Митрополит Каширский Феогност совершил Божественную литургию в престольный праздник Новодевичьего монастыря

После Смоленского собора второй каменной постройкой на территории монастыря является комплекс зданий, включающий одноглавую церковь Амвросия Медиоланского, трапезную и жилые палаты. Эти здания строились в течение XVI века и были завершены к 1598 году, но впоследствии неоднократно перестраивались. Архитектура этих построек созвучна с архитектурой XVI века – здания выполнены в характерных для своего времени монументальных формах и имеют сдержанный декор. В январе 1598 года в этих палатах поселилась вдова царя Федора Иоанновича – Ирина Годунова, постриженная в монахини с именем Александра. До перестройки в 1770 году по инициативе архиепископа Московского Амвросия (Зертис-Каменского) храм являлся домовой церковью и был освящен во имя святого Иоанна Предтечи. Его переосвящение связано с Чумным бунтом 1771 года. Храм переименовали в честь Амвросия Медиоланского, святого покровителя архиепископа Амвросия, запечатлев таким образом память о мученической смерти московского святителя, растерзанного обезумевшей толпой.

После Октябрьского переворота 1917 года в церкви еще долго шли службы. С 1930-х по 1990-е годы церковь, как и весь монастырь, находилась в ведении Государственного Исторического музея. В 1994 году в Новодевичьем монастыре возобновилась монашеская жизнь. Храм святителя Амвросия Медиоланского передали Церкви одним из первых.